主要诊治一般性的内科疾病如：头痛、头晕、腹痛、肠胃不适等等，针对病患先行对症治疗与评估，并进一步转介至各专科作后续医疗照顾。余各类传染性疾病，如；感冒、呼吸道感染等等，亦为诊疗范围。
呼吸内科配有 OLYPUS、FUJUN 多套电子内镜及其附属诊疗设备；SPIROLABⅡ 肺功能仪；DRAGGER 呼吸机等先进医疗设备。主要开展呼吸系统常见多发病如：肺炎、上呼吸道感染、慢性支气管炎、COPD、哮喘等的诊疗；危重病如气胸、呼吸衰竭、咯血、肺栓塞等病症的诊治；疑难少见病如特发性肺纤维化、肺结节等间质性肺疾病的诊治和慢性咳嗽久治不愈的诊治。电子支气管镜检查与支气管镜相关介入治疗。
医生姓名：李天林
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：呼吸内科
医生姓名：林孟志
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：呼吸内科
医生姓名：孙晋华
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：呼吸内科
医生姓名：黄馨莹
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：呼吸内科
糖尿病除给予糖尿病患者药物治疗之外，亦提供针对糖尿病患者的饮食的建议，并针对糖尿病引发的并发症给予初步的筛检，以及后续治疗。肥胖症的治疗，为肥胖患者提供检查和减肥指南。内分泌科不仅对糖尿病、甲亢等常见病和多发病的诊治水平前列，对肾上腺、垂体、性腺疾病、肥胖症、骨质疏松症、更年期综合症、痛风、甲状腺功能退症等疾病的诊治也有明显优势。
医生姓名：苏国涛
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：内分泌科
医生姓名：刘玉萍
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：内分泌科
医生姓名：罗素芬
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：内分泌科
神经内科下设脑电图、诱发电位及肌电图检查室，主要开展头痛癫痫、中风、半身不遂、肌力减退丧失、肢体无力或脑膜炎、肌肉病变、各种神经痛、抽慉、痉挛、手脚颤抖、不自主运动、步履不稳、失语症、意识障碍、痴呆、晕眩、腰酸背痛、眼球运动障碍、颜面神经麻痹、职业性神经系统疾病、记忆力不良等诊疗项目。
医生姓名：邹亚芬
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：神经内科
医生姓名：唐江威
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：神经内科
医生姓名：陈丹
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：神经内科
医生姓名：贾晓燕
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：神经内科
肾脏内科配有费森优斯血透机三台，能独立开展肾穿刺活检及病理诊断技术，肾小管功能监测、尿红细胞形态、尿微蛋白定量监测等专科检验诊断技术。主要开展肾脏炎、血尿、尿蛋白、水肿、肾结石、尿路感染、电解质不平衡、中毒、腰痛、高血压、肾衰竭、尿毒症等诊疗项目。
消化内科设有内视镜检查室二间，主要开展腹痛、胃溃疡、黑色便、血便、大便习惯改变、食欲不振、胃酸、十二指肠溃疡、吐血、吞咽困难、皮肤黄染、甲乙肝炎带原体测定、肝机能异常、肝胆结石、肝硬化等诊疗项目。
医生姓名：吴国荣
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：消化内科
医生姓名：王力涛
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：消化内科
医生姓名：张瑜
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：消化内科
医生姓名：陈昱宇
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：消化内科
心脏内科附设冠心病监护病房、两个心导管室、一个心脏超声室及运动心电图检查室等，主要开展心脏衰竭、心律不整、心悸、先天性心脏病、风湿性心脏病、心绞痛、高血压、高血脂及其它各类心脏暨血管疾病诊疗业务。
医生姓名：张一芝
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：心内科
医生姓名：李斌
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：心内科
医生姓名：赵丽娜
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：心内科
医生姓名：廖建宁
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：心内科
骨科由多名资深大陆和台湾骨科专家联合构建，并由台湾长庚医院各专业的知名骨科专家长期驻诊厦门长庚医院，主治以下疾病： 1、创伤骨科：四肢、骨盆损伤的各种内、外固定治疗；骨髓炎的诊断及后续治疗。 2、关节外科：肩、肘、髋、膝人工关节置换；膝、髋、踝、肩、肘、腕关节镜微创手术治疗各种类型关节病变及各种诸如膝关节半月板，前、后十字韧带，肩袖等运动损伤。
医生姓名：沈文晖
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：骨科
医生姓名：胡家瑞
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：骨科
医生姓名：郭继阳
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：骨科
医生姓名：黄泽波
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：骨科
厦门长庚医院泌尿外科目前有主任医师４位，副主任医师２名。现有床位３１张，科室具备先进完备的检查、检验及治疗设施，可以进行各种泌尿外科所需的临床检查化验和治疗，拥有国内优异的膀胱镜检查设备、体外震波碎石机、超声波诊断仪、尿流动力学诊断仪。近期还将大量引进具备国际先进水平的设备，以求能够更好的服务病患。
医生姓名：王宏臻
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：泌尿外科
医生姓名：祝华
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：泌尿外科
医生姓名：王学科
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：泌尿外科
医生姓名：符定军
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：泌尿外科
普外科系（乳腺外科，胃肠外科，胆道外科，肝脏外科，胰脏外科，甲状腺外科，疝气外科，结肠、直肠和肛门外科，周边血管外科，微创外科，急症外伤科）可诊治的疾病范围广泛，包括皮肤及皮下组织之炎症和肿瘤，内分泌肿瘤及机能异常，例如甲状腺和副甲状腺的外科疾病，消化外科包括食道、胃肠道、肝胆胰脾、结肠直肠和肛门的外科疾病，乳腺的疾病，例如疼痛、炎症及肿块。微创的腹腔镜手术，急症创伤外科，疝气治疗，静脉曲张以及器官移植等皆为范畴。本科现有主治医师6位，均为专科医师，每位医师各有其专长。
医生姓名：徐继芝
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：普外科
医生姓名：纪淞耀
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：普外科
医生姓名：张北叶
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：普外科
医生姓名：黄熙
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：普外科
神经外科目前拥有４位医师，其中主任医师２名，副主任医师１名，开设床位数３５张，对脑血管病、颅脑肿瘤、先天性颅脑等疾病有较高水平的诊断和治疗经验，，拥有成套的国际先进水平的神经外科手术设备和器械， 我科将继续加强与国内外的学术组织的交流，全面提高我科人员的综合素质，力争早日达到国内神经外科先进水平行列。
厦门长庚医院整形外科现有床位数３５张，主任医师２名，副主任医师２名，主治医师１名。适应新时代的发展，我科目前科开展的新技术项目也在不断更新，如严重烧伤后头、面、颈、四肢功能部位严重瘢痕挛缩畸形的手术修复，磨削术治疗面部化学烧伤、面部瘢痕，脂肪移植术，乳房巨乳症和小乳症的整形外科手术，全颜面去皱术，额肌瓣悬吊术治疗眼睑下垂，隆鼻术，全鼻再造术，腋臭搔刮术，体形雕塑吸脂术，巨大色素痣及乳腺癌术后乳腺再造术等新技术。
医生姓名：李弘毅
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：整形外科
医生姓名：陈国鼎
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：整形外科
医生姓名：陈润茺
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：整形外科
医生姓名：陈盈安
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：整形外科
厦门长庚医院心胸外科科室成员技术力量雄厚，专业技术水平高，拥有国内外先进的仪器设备，现有主任医师两名，主治医师两名 。心胸外科目前能够开展包括冠状动脉旁路移植术，重症心脏瓣膜置换术，胸主动脉瘤切除术，复杂先天性心脏根治及姑息手术、肺良恶性肿瘤，食管良恶性肿瘤，纵膈肿瘤，胸壁畸形，胸外伤，胸壁疾病，多汗症等多种手术。厦门长庚医院心胸外科全体医师全力以赴，努力跟随国际先进的治疗理念，以病人为中心，为闽西南的广大患者服务，为心胸外科学术发展做出新的贡献。
随着厦门长庚医院试营运开始，妇产科即开始提供各类妇产科疾病治疗服务。依托台湾长庚之经验及支持并结合厦门长庚实际，妇产科以重症治疗为目标，除开展各类妇产科医疗服务外，将重点发展妇科腔镜手术治疗妇科肿瘤等，并期待未来在试管婴儿等生殖技术方面有所贡献。
随着厦门长庚医院试营运开始，儿科已开始提供各类儿童疾病治疗服务。依托台湾长庚之经验及支持并结合厦门长庚实际，儿科以重症治疗为目标，除开展儿科常见病及多发病的诊治，将重点发展新生儿照护、儿童血液疾病治疗等，并期待未来在儿童白血病治疗方面有所贡献。
厦门长庚医院耳鼻喉科集海峡两岸精英医疗组成，是我院优先发展特色专科之一。２００９年成为卫生部、中残联“人工耳蜗定点手术医院”单位（全国仅２０所定点手术医院，闽南地区少有定点医院）；２０１１年成为福建省耳鼻咽喉科住院医师规范化培训基地。耳鼻咽喉头颈外科目前床位３３张，有主任、副主任医师５名，主治医师3名；拥有蔡司手术显微镜、面神经监护仪、STORZ鼻内镜、手术动力系统、电子喉镜、VNG眩晕检查仪、ABR、OAE等各种听力检测设备等高尖精的诊疗设备。
血液肿瘤科主要开展包括胃癌、肺癌、食管癌、结直肠癌、胰腺癌、乳腺癌、肝癌、鼻咽癌、口腔癌等各种肿瘤的化学疗法。
厦门长庚口腔科已进驻阵容强大的口腔医师团队，对于口腔病症的研究及医疗不遗余力，医师们各有专长，依托台湾长庚之经验及支持并结合厦门长庚实际，口腔科以口腔疾病与口腔外科疑难杂症为目标，除开展各类口腔科医疗服务外，将重点发展口腔颌面外科、口腔颌面部恶性肿瘤、唇腭裂的综合序列治疗等，现已成功开展了种植牙及高难度的正颌外科手术，口腔肿瘤序列治疗等等。
厦门长庚医院眼科与有三十年历史的台湾长庚医院眼科联合开设青光眼、白内障、玻璃体视网膜（眼底病）、斜弱视与小儿眼科、眼整形、眼外伤、眼屈光及综合眼病等多个专科；开展晶体超声乳化摘除术、现代囊外摘除术及人工晶体植入等白内障手术、青光眼小梁切除手术、视网膜玻璃体疾病的药物综合治疗，视网膜玻璃体手术以及斜视矫正、眼外伤修复，眼表羊膜移植术、泪道、眼眶及眼部整形等手术。眼科YAG激光可进行人工晶体后发障切开术、青光眼治疗、虹膜粘连松解术等，多波长氪激光治疗视网膜裂孔、中心性视网膜脉络膜病变、视网膜静脉阻塞，糖尿病性视网膜病变，视网膜血管炎，眼底血管瘤等眼底出血病以及间接镜激光治疗视网膜早产儿病变和视网膜母细胞瘤，COATS病。
厦门长庚医院急诊科是以台湾长庚急诊医学为依托，秉承国际先进的急诊医学理念，由海峡两岸医务人员共同组成一个良好合作团队。引进国际先进检伤分类制度，能让真正危急重症患者得到医疗的优先处置。未来将进一步完善疾病检伤分类制度，加强国际间急诊医学的交流与合作，成为中国急诊医学的典范。
厦门长庚医院皮肤科已进驻阵容强大的皮肤科团队，对于皮肤病症的研究及医疗不遗余力，医师们各有专长，皆为台湾皮肤科权威专家，除此，本科率先引进国外较新激光及脉冲光设备，开启皮肤医学美容新的里程碑，处理关心民众一般皮肤问题外，更提供有效可靠的激光美容服务，欢迎有需要民众来我院咨询，本科将提供专业、用心的医疗及美容服务。
本院康复科服务范围包括神经肌肉复健，脊椎病变复健，骨骼肌肉复健，肩颈背酸痛，各种肌腱、韧带及肌肉拉伤及挫伤，肌腱炎，足底筋膜炎，广泛性筋骨酸痛，脊椎侧弯，副木假肢，关节炎及骨质疏松复健，儿童发展与复健，软组织超音波检查。随着年龄之增长，罹患慢性病之机会也相对增大，本科更加强脊椎损伤后复健，中风复健及头部外伤后复健，语言及吞咽障碍之复健，如何让病患不只是寿命的延长，而且还要活得更有意义与尊严，便为康复科专业同仁之共同目标及希望，正所谓：医学为人类增添岁月，康复为岁月增加生命。
厦门长庚医院麻醉科现有主任医师３人、副主任医师２人、主治医师２人，科室内个成员均具有较丰富的麻醉经验，适应新时代的要求麻醉科开展新的技术，主要有：新型静脉麻醉药、肌肉松弛药、麻醉性镇痛药以及静脉目标输注系统的应用、吸入麻醉药安氟醚、异氟醚、地氟醚、七氟醚以及低流量吸入麻醉，使得吸入麻醉更接近于理想；新的麻醉方法与技术（腰硬联合麻醉、术后镇痛、无痛诊疗）、新的监测技术（连续心输出量、肺动脉测压、听觉诱发电位等）在临床陆续应用；新的治疗理念如容量治疗、血液保护措施在临床应用；全面开展麻醉质量控制，对各种麻醉方法及操作均制定相应规范和常规，使得临床麻醉质量显着提高。
