纽约长老会医院的心脏科在《美国新闻和世界报道》评定的“2022-23美国医院-心脏科”排名第四。
       作为一个主要的学术医疗中心，该科的医生们领导、参加了多组临床试验，并极大提高了心脏疾病的治疗水平。中心还致力于降低个人罹患心脏疾病的风险，如患有糖尿病，高血压，高胆固醇，以及吸烟者和肥胖者，帮助他们选择采取健康的生活方式。
       医疗项目包括：心脏康复；先天性心脏病；冠心病；诊断技术；心力衰竭；心律失常；心脏移植手术；心脏瓣膜修复和更换；肥厚型心肌病；胸主动脉瘤。

       纽约长老会医院的神经医学中心在《美国新闻和世界报道》评定的“2022-23美国医院-神经科”排名第三。
       该神经医学中心结合了哥伦比亚大学医疗中心的神经学研究所和康奈尔医学院神经医学中心的专业知识，提供具创新性的，前沿的治疗方案，对神经系统疾病进行全方位的诊治。哥伦比亚的神经学研究所成立于1909年，是北美国际公认的一个专门从事神经系统疾病治疗的医疗中心。该研究所是全球处理较多中风病例的地方，拥有全纽约州动脉瘤手术较低的死亡率，是低温停循环技术外科发展的先驱。康奈尔医学院神经医学中心对神经系统疾病患者提供全面照护。此外，该中心是创新研究的领头羊，促进理解和治疗神经系统疾病。该神经科医学中心显著成就包括开拓迷走神经刺激作为一种治疗癫痫患者的方式，建立一个国际公认的用于脑外伤治疗的协议，领导多发性硬化研究。
       医疗项目包括：阿尔茨海默氏病；动脉瘤；动静脉畸形；脑及脊椎外伤；脑及脊椎肿瘤；颈动脉狭窄；脑血管疾病；儿童神经内外科；癫痫；头痛；免疫系统紊乱；多发性硬化症；神经危重疾病；神经肌肉疾病；视神经脊髓炎；神经系统结节病；帕金森病及运动障碍；睡眠障碍；脊椎疾病；中风。

       纽约长老会医院特种外科医院的风湿科在《美国新闻和世界报道》评定的“2022-23美国医院-风湿科”排名第三。
       纽约长老会医院的风湿病学项目是由隶属于康奈尔医学院和特种外科医院的科室、以及哥伦比亚大学的内科医生和外科医生组成。该项目为有广泛炎症和自身免疫性疾病的患者提供先进的照护。在实验室水平和临床学习追求开创性研究，并对住院医生和研究员提供综合培训。
       该部门是国内较大的风湿病学项目，有31个全职风湿病专家和3个儿科风湿病专家，每年诊治9000新患者并对28000名患者进行随访，提供门诊和住院治疗。

       纽约长老会医院的泌尿外科在《美国新闻和世界报道》评定的“2022-23美国医院-泌尿外科”排名第五。
       该中心的泌尿科医生将重点放在微创手术治疗泌尿系统癌症上。机器人手术和微创手术应用广泛，其方法的优点是切口小，出血少，缩短了术后恢复时间并降低了术后疼痛。该中心的治疗方法已经彻底改变了局部前列腺癌的治疗，减少了副作用的产生;另外，医生也在带领开发新的管理晚期前列腺癌的方法。
       医疗项目包括：前列腺，膀胱，肾，或睾丸的癌症；良性前列腺状况；肾结石；失禁；女性泌尿；小儿泌尿外科；生育问题；性状况。

       纽约长老会医院的精神科在《美国新闻和世界报道》评定的“2022-23美国较好医院-精神科”排名第四。
       纽约长老会精神科将哥伦比亚大学医学院和威尔康乃尔医学院的学术人员聚集在一起，以推动该领域诊断精度和改善各年龄段有效治疗方法为共同使命。
       从早期发病和后期干预，纽约长老会精神病学为所有精神疾病提供了专业知识。无论是管理初次疾病或是慢性未解决疾病，团队通过在富于同情心且谨慎的环境中提供坚定地个性化的诊断和治疗来区别自身。专业人员致力于从基础研究到临床应用为神经生物学和基因组学带来突破性的研究，加速将科学发现转化为对患者的循证治疗。
       精神病学服务包括：儿童和青少年精神病学；综合精神病学应急程序；抑郁症和焦虑症；饮食失调；老年精神病学；人格障碍；精神障碍；药物和酒精的滥用；女性心理健康。

       纽约长老会医院肾脏科在《美国新闻和世界报道》评定的“2020-21美国较好医院-肾脏科”排名第二。
       复杂性肾脏疾病和泌尿疾病都可以在这里找到全方位的治疗方案。肾脏科的肾脏病学家与肾移植部门或外科密切合作，肾移植方案为患者及家属提供移植前后的辅导，新的治疗方法也被应用于帮助减少抗排斥药物的副作用。
       肾脏科的服务包括咨询，急性和慢性透析，血浆分离置换法和连续性肾脏替代治疗。该部门每年处理300至400例和肾脏病有关的咨询，8000至9000例血液透析，并为90至100例肾移植者提供医疗保健。其主要焦点是移植免疫学和分子生物学，医师检查用于移植受者的免疫抑制药的作用机制，测试指导移植患者的药物治疗并制定治疗策略以保护移植器官。

       纽约长老会医院老年科在《美国新闻和世界报道》评定的“2018-19美国较好医院-老年科”排名第十四。
       纽约长老会医院拥有两个老龄中心：曼哈顿上东区靠近纽约长老会/威尔康奈尔院区的Irving S. Wright老年健康中心和位于纽约长老会/曼哈顿茵伍德地区艾伦医院的老年医学和老龄化部门。
       该中心是由医生、护士和其他专门从事老年人治疗的照顾者组成，他们还协助其他部门的专家促进护理。

       纽约长老会医院的内分泌外科在《美国新闻和世界报道》评定的“2022-23美国较好医院-内分泌科”排名第四。
       内分泌外科是一个专注于甲状腺、甲状旁腺和肾上腺的疾病（主要是良性和恶性肿瘤）以及胃肠道和胰腺的内分泌肿瘤等疾病管理的专业的外科领域，纽约长老会医院内分泌外科部门提供优异的患者护理并通过研究与教学促进有关这些腺体疾病知识的发展。
内分泌外科的重点是采用微创技术提供优异的服务，其外科医生在这些技术方面有着丰富的经验，中心采用局部麻醉下小切口实施甲状腺和甲状旁腺手术，有可能的情况下，通过腹腔镜技术开拓手术路径行肾上腺肿瘤摘除术。
       纽约长老会威尔康奈尔医院的内分泌外科在甲状腺结节和癌症，肾上腺肿瘤和紊乱，甲状旁腺机能亢进和其他甲状腺疾病，胰腺和胃肠道内分泌肿瘤等疾病的手术治疗方面提供广泛的专家护理。

       纽约长老会医院的呼吸科在《美国新闻和世界报道》评定的“2016-17美国医院-呼吸科”排名第八。
       纽约长老会医院在过敏、免疫疾病和呼吸系统疾病方面进行广泛的诊断和治疗，中心的肺病过敏和重症医学科被认为是国内优异的肺病治疗科，该科包含几个专业组。
       约翰 伍德-约翰 爱德森哮喘中心包含一个专业住院服务和一个专业门诊诊所。中心提供专业诊断服务、免疫疗法和哮喘相关的其他疾病筛查。此外，哮喘中心的员工审查环境诱因以确定哪些室外和室内过敏原可能激活症状。
       与心肺相关的睡眠和通气障碍实验室是一个新开发的综合项目，研究各种与睡眠相关的呼吸障碍，如阻塞性睡眠呼吸暂停、呼吸暂停和充血性心力衰竭和神经系统疾病相关的节律性呼吸，婴儿猝死综合症，夜间哮喘，慢性阻塞性肺疾病，神经肌肉疾病等。