北京马应龙长青肛肠医院隶属于马应龙肛肠连锁医院体系，是一家新型连锁股份制医院。其股东马应龙药业集团(上海交易所上市企业，股票代码600993)，是具有四百多年历史的中华老字号企业。马应龙药业集团利用其在肛肠领域上百年的制药经验及雄厚的技术实力，发起组建了马应龙肛肠连锁医院体系，以便为肛肠病人提供全套的综合诊疗解决方案，实现其“客户一元化，服务多元化”的目标。迄今为止，马应龙肛肠连锁医院体系已遍布北京、武汉、沈阳、南京、西安等全国各地。
北京马应龙长青肛肠医院是北京三级甲等中医肛肠专科医院，是北京市基本医疗保险定点医疗机构、北京市海淀区新型农村合作医疗定点医疗机构、全国中医药肛肠专科继续教育基地、中华中医药学会肛肠分会副会长兼秘书长单位、中华中医药学会肛肠病治疗中心，承担了国家中医药管理局肛肠病重点专科的建设工作。在重点专科项目建设期间担任国家中医药管理局肛肠病重点专科“直肠脱垂”协作组组长单位、“便秘”协作组副组长单位，承担“中医药治疗肛肠病”课题研究，完成了“直肠脱垂”、“便秘”病种的临床路径、诊疗方案的制定、验证和推广工作。
由于拥有一支技术力量雄厚的肛肠专家团队，北京马应龙长青肛肠医院已成为马应龙肛肠连锁医院体系的技术中心，近年来，医院致力于肛肠疾病精湛技术的研究与开发，通过引进人才及先进的医疗技术，开发出全程微创微痛治疗、手术与注射相结合、门诊治疗与住院治疗相结合、排便困难的治疗等特色疗法，为了满足不同人群的需要，医院配有包间病房、普通病房及医保病房，病房设施齐全、温馨，为患者提供了一个贴心、私密、温馨的治疗康复的医疗环境。
北京马应龙长青肛肠医院位于北京西部清华科技园·玉泉慧谷园区内，园区地处中关村高科技园区辐射地带，交通便利，风景宜人。东临皇家园林颐和园，北濒玉泉山，西接北京香山风景区，纳“三山”之灵气，融“五园”之神韵，处于三山五园之间，属京华上风上水之地，浓厚的自然气息萦绕其中。她自诞生之起，就坐落在北京的绿谷氧吧之中，林间清风挟新鲜氧气扑面，为患者提供自然、惬意、灵性的休养空间，使患者享受一个度假式的住院治疗期。